وبناءً على المادتين 87 و 133 من الدستور، ونظرا للثقة التي منحها مجلس الشورى الاسلامي لمحمد علي نيكبخت لتولي منصب وزير الجهاد الزراعي فقد أوكل اليه رئيس الجمهورية ابراهيم رئيسي مهمة تنفيذ 13 مهمة على النحو التالي:
1. تخطيط وتنفيذ السياسات العامة والوثائق التمهيدية في مجال الزراعة
2. بذل جهد خاص لتحقيق الأمن الغذائي مع نهج التنويع
3. التوريد الداخلي للمدخلات والاكتفاء الذاتي من السلع الأساسية
4. تطوير سلسلة القيمة للمنتجات الزراعية
5. اضفاء الذكاء على عملية المزرعة إلى السوق
6. الاستفادة القصوى من العلم والتكنولوجيا بهدف زيادة الإنتاجية والاستهلاك الأمثل للمياه
7. الحفاظ المستدام واستعادة الموارد الطبيعية والأراضي الزراعية
8. التعامل الحاسم مع تغيير الاستخدامات غير المصرح بها
9. خلق نماذج جديدة مستقرة واقتصادية للدولة
10. إنشاء وإطلاق نموذج جديد للحوكمة الزراعية يعتمد على إحصاءات البيانات الزراعية بطريقة إلكترونية وموجهة نحو الموقع
11. تغيير كبير في إنتاجية طاقات الإنتاج الزراعي
12. اعتماد نهج التعميم الأقصى
13. تحديد واستخدام المديرين الشباب الثوريين والخبراء.